Bizarre. Un antibiogramme sert à tester la sensibilité d'une souche à un antibiotique, et non à identifier une bactérie pathogène. Mais peut-être le véto a-t-il plutôt réalisé une coproculture ?
Concernant les sulfamides, qui ne sont pas des antibiotiques, il est indiqué sur les notices qu'il ne faut pas en donner en période de reproduction (que dit la notice du Bactrim ?) car ils stérilisent temporairement les femelles. Mais si cela n'a pas été le cas chez toi avec le Bactrim, alors tant mieux, et bonne continuation !!! 
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Je ne vois pas ce qu'il y a de bizarre! J'ai également eu recours à un antibiogramme l'an dernier sur un oisillon mort. Ils identifient d'abord les éventuelles bactéries avant de tester leurs sensibilité.
Cordialement